Index

A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X

A

abs() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
acceptor_metal() (in module oddt.interactions)
activities (oddt.datasets.pdbbind attribute)
add() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
add_prefix() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
add_suffix() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
addh() (oddt.toolkits.ob.Molecule method)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule method)
agg() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
aggregate() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
align() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
all() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
angle() (in module oddt.spatial)
angle_2v() (in module oddt.spatial)
any() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
append() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
apply() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
apply_filter() (oddt.virtualscreening.virtualscreening method)
applymap() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
argmax() (oddt.pandas.ChemSeries method)
argmin() (oddt.pandas.ChemSeries method)
argsort() (oddt.pandas.ChemSeries method)
as_blocks() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
as_matrix() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
asfreq() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
asobject (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
asof() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
assign() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
astype() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
at (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
at_time() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
Atom (class in oddt.toolkits.ob)
(class in oddt.toolkits.rdk)
atom_dict (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
atomicmass (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
atomicnum (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Atom attribute)
atoms (oddt.toolkits.ob.Bond attribute)
(oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.ob.Residue attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Bond attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Residue attribute)
AtomStack (class in oddt.toolkits.ob)
(class in oddt.toolkits.rdk)
auc() (in module oddt.metrics)
autocorr() (oddt.pandas.ChemSeries method)
autodock_vina (class in oddt.docking)
(class in oddt.docking.AutodockVina)
autodock_vina_descriptor (class in oddt.scoring.descriptors)
axes (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)

B

base (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
base_feature_factory (in module oddt.toolkits.rdk)
between() (oddt.pandas.ChemSeries method)
between_time() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
bfill() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
binana_descriptor (class in oddt.scoring.descriptors.binana)
bits (oddt.toolkits.ob.Fingerprint attribute)
blocks (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
Bond (class in oddt.toolkits.ob)
(class in oddt.toolkits.rdk)
bonds (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
(oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Atom attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
BondStack (class in oddt.toolkits.ob)
(class in oddt.toolkits.rdk)
bool() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
boxplot() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
build() (oddt.scoring.descriptors.autodock_vina_descriptor method)
(oddt.scoring.descriptors.binana.binana_descriptor method)
(oddt.scoring.descriptors.close_contacts method)
(oddt.scoring.descriptors.fingerprints method)
(oddt.scoring.descriptors.oddt_vina_descriptor method)
(oddt.scoring.ensemble_descriptor method)

C

calccharges() (oddt.toolkits.ob.Molecule method)
calcdesc() (oddt.toolkits.ob.Molecule method)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule method)
calcfp() (oddt.pandas.ChemSeries method)
(oddt.toolkits.ob.Molecule method)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule method)
canonic_order (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
cat (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
change_dihedral() (in module oddt.docking.internal)
charge (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
charges (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
ChemDataFrame (class in oddt.pandas)
ChemPanel (class in oddt.pandas)
ChemSeries (class in oddt.pandas)
cidx (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
clean() (oddt.docking.autodock_vina method)
(oddt.docking.AutodockVina.autodock_vina method)
clear() (oddt.toolkits.ob.MoleculeData method)
(oddt.toolkits.rdk.MoleculeData method)
clip() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
clip_lower() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
clip_upper() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
clone (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
clone_coords() (oddt.toolkits.ob.Molecule method)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule method)
close() (oddt.toolkits.ob.Outputfile method)
(oddt.toolkits.rdk.Outputfile method)
close_contacts (class in oddt.scoring.descriptors)
close_contacts() (in module oddt.interactions)
combine() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
combine_first() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
common_usr() (in module oddt.shape)
compound() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
compress() (oddt.pandas.ChemSeries method)
conform() (oddt.pandas.ChemPanel method)
conformers (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
consolidate() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
convert_objects() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
convertdbonds() (oddt.toolkits.ob.Molecule method)
coordidx (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
coords (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
(oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Atom attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
copy() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
corr() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
correct_radius() (oddt.docking.internal.vina_docking method)
corrwith() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
count() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
cov() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
cross_validate() (in module oddt.scoring)
cummax() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
cummin() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
cumprod() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
cumsum() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)

D

data (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
(oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
describe() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
descs (in module oddt.toolkits.rdk)
detect_secondary_structure() (in module oddt.toolkits.common)
dice() (in module oddt.fingerprints)
diff() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
dihedral() (in module oddt.spatial)
dim (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
distance() (in module oddt.spatial)
div() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
divide() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
dock() (oddt.docking.autodock_vina method)
(oddt.docking.AutodockVina.autodock_vina method)
(oddt.virtualscreening.virtualscreening method)
dot() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
draw() (oddt.toolkits.ob.Molecule method)
drop() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
drop_duplicates() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
dropna() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
dt (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
dtype (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
dtypes (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
duplicated() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)

E

ECFP() (in module oddt.fingerprints)
electroshape() (in module oddt.shape)
empty (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
energy (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
enrichment_factor() (in module oddt.metrics)
ensemble_descriptor (class in oddt.scoring)
ensemble_model (class in oddt.scoring)
eq() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
equals() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
eval() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
ewm() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
exactmass (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
(oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
expanding() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)

F

factorize() (oddt.pandas.ChemSeries method)
fetch() (oddt.virtualscreening.virtualscreening method)
ffill() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
fillna() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
filter() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
findall() (oddt.toolkits.ob.Smarts method)
(oddt.toolkits.rdk.Smarts method)
Fingerprint (class in oddt.toolkits.ob)
(class in oddt.toolkits.rdk)
fingerprints (class in oddt.scoring.descriptors)
first() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
first_valid_index() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
fit() (oddt.scoring.ensemble_model method)
(oddt.scoring.functions.NNScore.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.RFScore.rfscore method)
(oddt.scoring.functions.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.rfscore method)
(oddt.scoring.models.classifiers.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.classifiers.svm method)
(oddt.scoring.models.regressors.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.regressors.svm method)
(oddt.scoring.scorer method)
flags (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
floordiv() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
forcefields (in module oddt.toolkits.rdk)
formalcharge (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Atom attribute)
formula (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
fps (in module oddt.toolkits.rdk)
from_array() (oddt.pandas.ChemSeries method)
from_csv() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
from_dict() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
from_items() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
from_records() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
fromDict() (oddt.pandas.ChemPanel method)
ftype (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
ftypes (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)

G

ge() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
gen_training_data() (oddt.scoring.functions.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.NNScore.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.RFScore.rfscore method)
(oddt.scoring.functions.rfscore method)
get() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
get_children() (in module oddt.docking.internal)
get_close_neighbors() (in module oddt.docking.internal)
get_dtype_counts() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
get_ftype_counts() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
get_params() (oddt.scoring.models.classifiers.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.classifiers.svm method)
(oddt.scoring.models.regressors.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.regressors.svm method)
get_value() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
get_values() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
groupby() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
gt() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)

H

halogenbond_acceptor_halogen() (in module oddt.interactions)
halogenbonds() (in module oddt.interactions)
has_key() (oddt.toolkits.ob.MoleculeData method)
(oddt.toolkits.rdk.MoleculeData method)
hasnans (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
hbond_acceptor_donor() (in module oddt.interactions)
hbonds() (in module oddt.interactions)
head() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
heavyvalence (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
heterovalence (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
hist() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
hyb (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
hydrophobic_contacts() (in module oddt.interactions)

I

iat (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
ids (oddt.datasets.pdbbind attribute)
idx (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
(oddt.toolkits.ob.Residue attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Atom attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Residue attribute)
idx0 (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Atom attribute)
idx1 (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Atom attribute)
idxmax() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
idxmin() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
iloc (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
imag (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
implicitvalence (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
info() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
informats (in module oddt.toolkits.rdk)
insert() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
InteractionFingerprint() (in module oddt.fingerprints)
interpolate() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
is_copy (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
is_monotonic (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
is_monotonic_decreasing (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
is_monotonic_increasing (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
is_unique (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
isin() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
isnull() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
isotope (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
isrotor (oddt.toolkits.ob.Bond attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Bond attribute)
item() (oddt.pandas.ChemSeries method)
items() (oddt.toolkits.ob.MoleculeData method)
(oddt.toolkits.rdk.MoleculeData method)
itemsize (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
iteritems() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
(oddt.toolkits.ob.MoleculeData method)
(oddt.toolkits.rdk.MoleculeData method)
iterrows() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
itertuples() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
ix (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)

J

join() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)

K

keys() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
(oddt.toolkits.ob.MoleculeData method)
(oddt.toolkits.rdk.MoleculeData method)
kurt() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
kurtosis() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)

L

last() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
last_valid_index() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
le() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
load() (oddt.scoring.functions.nnscore class method)
(oddt.scoring.functions.NNScore.nnscore class method)
(oddt.scoring.functions.RFScore.rfscore class method)
(oddt.scoring.functions.rfscore class method)
(oddt.scoring.scorer class method)
load_ligands() (oddt.virtualscreening.virtualscreening method)
loc (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
localopt() (oddt.toolkits.ob.Molecule method)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule method)
lookup() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
lt() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)

M

mad() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
major_xs() (oddt.pandas.ChemPanel method)
make2D() (oddt.toolkits.ob.Molecule method)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule method)
make3D() (oddt.toolkits.ob.Molecule method)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule method)
map() (oddt.pandas.ChemSeries method)
mask() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
match() (oddt.toolkits.ob.Smarts method)
(oddt.toolkits.rdk.Smarts method)
max() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
mean() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
median() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
melt() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
memory_usage() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
merge() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
min() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
minor_xs() (oddt.pandas.ChemPanel method)
mlr (in module oddt.scoring.models.regressors)
mod() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
mode() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
Mol (oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
Molecule (class in oddt.toolkits.ob)
(class in oddt.toolkits.rdk)
MoleculeData (class in oddt.toolkits.ob)
(class in oddt.toolkits.rdk)
MolFromPDBBlock() (in module oddt.toolkits.extras.rdkit)
molwt (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
mul() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
multiply() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
mutate() (oddt.docking.internal.vina_ligand method)

N

name (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
(oddt.toolkits.ob.Residue attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Residue attribute)
nbytes (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
ndim (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
ne() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
neighbors (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Atom attribute)
neuralnetwork (class in oddt.scoring.models.classifiers)
(class in oddt.scoring.models.regressors)
nlargest() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
nnscore (class in oddt.scoring.functions)
(class in oddt.scoring.functions.NNScore)
nonzero() (oddt.pandas.ChemSeries method)
notnull() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
nsmallest() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
num_rotors (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
num_rotors_pdbqt() (in module oddt.docking.internal)
nunique() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)

O

OBMol (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
oddt (module)
oddt.datasets (module)
oddt.docking (module)
oddt.docking.AutodockVina (module)
oddt.docking.internal (module)
oddt.fingerprints (module)
oddt.interactions (module)
oddt.metrics (module)
oddt.pandas (module)
oddt.scoring (module)
oddt.scoring.descriptors (module)
oddt.scoring.descriptors.binana (module)
oddt.scoring.functions (module)
oddt.scoring.functions.NNScore (module)
oddt.scoring.functions.RFScore (module)
oddt.scoring.models (module)
oddt.scoring.models.classifiers (module)
oddt.scoring.models.regressors (module)
oddt.shape (module)
oddt.spatial (module)
oddt.toolkits (module)
oddt.toolkits.common (module)
oddt.toolkits.extras (module)
oddt.toolkits.extras.rdkit (module)
oddt.toolkits.ob (module)
oddt.toolkits.rdk (module)
oddt.virtualscreening (module)
oddt_vina_descriptor (class in oddt.scoring.descriptors)
order (oddt.toolkits.ob.Bond attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Bond attribute)
outformats (in module oddt.toolkits.rdk)
Outputfile (class in oddt.toolkits.ob)
(class in oddt.toolkits.rdk)

P

parse_vina_docking_output() (in module oddt.docking.AutodockVina)
parse_vina_scoring_output() (in module oddt.docking.AutodockVina)
partialcharge (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Atom attribute)
pct_change() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
pdbbind (class in oddt.datasets)
pi_cation() (in module oddt.interactions)
pi_metal() (in module oddt.interactions)
pi_stacking() (in module oddt.interactions)
pipe() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
pivot() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
pivot_table() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
plot (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
pls (in module oddt.scoring.models.regressors)
pop() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
pow() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
predict() (oddt.scoring.ensemble_model method)
(oddt.scoring.functions.NNScore.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.RFScore.rfscore method)
(oddt.scoring.functions.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.rfscore method)
(oddt.scoring.models.classifiers.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.classifiers.svm method)
(oddt.scoring.models.regressors.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.regressors.svm method)
(oddt.scoring.scorer method)
predict_ligand() (oddt.docking.autodock_vina method)
(oddt.docking.AutodockVina.autodock_vina method)
(oddt.scoring.functions.NNScore.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.RFScore.rfscore method)
(oddt.scoring.functions.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.rfscore method)
(oddt.scoring.scorer method)
predict_ligands() (oddt.docking.autodock_vina method)
(oddt.docking.AutodockVina.autodock_vina method)
(oddt.scoring.functions.NNScore.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.RFScore.rfscore method)
(oddt.scoring.functions.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.rfscore method)
(oddt.scoring.scorer method)
predict_log_proba() (oddt.scoring.models.classifiers.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.classifiers.svm method)
predict_proba() (oddt.scoring.models.classifiers.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.classifiers.svm method)
prod() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
product() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
ptp() (oddt.pandas.ChemSeries method)
put() (oddt.pandas.ChemSeries method)

Q

quantile() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
query() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)

R

radd() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
random_roc_log_auc() (in module oddt.metrics)
randomforest (in module oddt.scoring.models.classifiers)
(in module oddt.scoring.models.regressors)
rank() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
ravel() (oddt.pandas.ChemSeries method)
raw (oddt.toolkits.ob.Fingerprint attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Fingerprint attribute)
rdiv() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
read_csv() (in module oddt.pandas)
read_mol2() (in module oddt.pandas)
read_sdf() (in module oddt.pandas)
readfile() (in module oddt.toolkits.ob)
(in module oddt.toolkits.rdk)
readstring() (in module oddt.toolkits.rdk)
real (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
reindex() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
reindex_axis() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
reindex_like() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
removeh() (oddt.toolkits.ob.Molecule method)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule method)
rename() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
rename_axis() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
reorder_levels() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
repeat() (oddt.pandas.ChemSeries method)
replace() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
res_dict (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
resample() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
reset_index() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
reshape() (oddt.pandas.ChemSeries method)
Residue (class in oddt.toolkits.ob)
(class in oddt.toolkits.rdk)
residue (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
residues (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
ResidueStack (class in oddt.toolkits.ob)
(class in oddt.toolkits.rdk)
rfloordiv() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
rfscore (class in oddt.scoring.functions)
(class in oddt.scoring.functions.RFScore)
ring_dict (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
rmod() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
rmsd() (in module oddt.spatial)
rmse() (in module oddt.metrics)
rmul() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
roc() (in module oddt.metrics)
roc_auc() (in module oddt.metrics)
roc_log_auc() (in module oddt.metrics)
rolling() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
rotate() (in module oddt.spatial)
round() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
rpow() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
rsub() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
rtruediv() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)

S

salt_bridge_plus_minus() (in module oddt.interactions)
salt_bridges() (in module oddt.interactions)
sample() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
save() (oddt.scoring.functions.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.NNScore.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.RFScore.rfscore method)
(oddt.scoring.functions.rfscore method)
(oddt.scoring.scorer method)
score() (oddt.docking.autodock_vina method)
(oddt.docking.AutodockVina.autodock_vina method)
(oddt.docking.internal.vina_docking method)
(oddt.scoring.ensemble_model method)
(oddt.scoring.functions.NNScore.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.RFScore.rfscore method)
(oddt.scoring.functions.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.rfscore method)
(oddt.scoring.models.classifiers.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.classifiers.svm method)
(oddt.scoring.models.regressors.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.regressors.svm method)
(oddt.scoring.scorer method)
(oddt.virtualscreening.virtualscreening method)
score_inter() (oddt.docking.internal.vina_docking method)
score_intra() (oddt.docking.internal.vina_docking method)
score_total() (oddt.docking.internal.vina_docking method)
scorer (class in oddt.scoring)
searchsorted() (oddt.pandas.ChemSeries method)
select() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
select_dtypes() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
sem() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
set_axis() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
set_box() (oddt.docking.internal.vina_docking method)
set_coords() (oddt.docking.internal.vina_docking method)
set_index() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
set_ligand() (oddt.docking.internal.vina_docking method)
set_params() (oddt.scoring.models.classifiers.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.classifiers.svm method)
(oddt.scoring.models.regressors.neuralnetwork method)
(oddt.scoring.models.regressors.svm method)
set_protein() (oddt.docking.autodock_vina method)
(oddt.docking.AutodockVina.autodock_vina method)
(oddt.docking.internal.vina_docking method)
(oddt.scoring.descriptors.autodock_vina_descriptor method)
(oddt.scoring.descriptors.binana.binana_descriptor method)
(oddt.scoring.descriptors.oddt_vina_descriptor method)
(oddt.scoring.ensemble_descriptor method)
(oddt.scoring.functions.NNScore.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.RFScore.rfscore method)
(oddt.scoring.functions.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.rfscore method)
(oddt.scoring.scorer method)
set_value() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
shape (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
shift() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
similarity() (oddt.virtualscreening.virtualscreening method)
similarity_SPLIF() (in module oddt.fingerprints)
SimpleInteractionFingerprint() (in module oddt.fingerprints)
size (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
skew() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
slice_shift() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
Smarts (class in oddt.toolkits.ob)
(class in oddt.toolkits.rdk)
smiles (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
sort_index() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
sort_values() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
sortlevel() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
spin (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
(oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
SPLIF() (in module oddt.fingerprints)
squeeze() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
sssr (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
stack() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
std() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
str (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
strides (oddt.pandas.ChemSeries attribute)
style (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
sub() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
subtract() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
sum() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
svm (class in oddt.scoring.models.classifiers)
(class in oddt.scoring.models.regressors)
swapaxes() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
swaplevel() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)

T

T (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
tail() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
take() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
tanimoto() (in module oddt.fingerprints)
title (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule attribute)
tmp_dir (oddt.docking.autodock_vina attribute)
(oddt.docking.AutodockVina.autodock_vina attribute)
to_clipboard() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_csv() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_dense() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_dict() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
(oddt.toolkits.ob.MoleculeData method)
(oddt.toolkits.rdk.MoleculeData method)
to_excel() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_feather() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
to_frame() (oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_gbq() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
to_hdf() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_html() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
to_json() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_latex() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
to_long() (oddt.pandas.ChemPanel method)
to_mol2() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_msgpack() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_panel() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
to_period() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_pickle() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_records() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
to_sdf() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_smiles() (oddt.pandas.ChemSeries method)
to_sparse() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_sql() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_stata() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
to_string() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_timestamp() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
to_xarray() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
tolist() (oddt.pandas.ChemSeries method)
toLong() (oddt.pandas.ChemPanel method)
train() (oddt.scoring.functions.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.NNScore.nnscore method)
(oddt.scoring.functions.RFScore.rfscore method)
(oddt.scoring.functions.rfscore method)
transform() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
transpose() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
truediv() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
truncate() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
tshift() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
type (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
tz_convert() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
tz_localize() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)

U

unique() (oddt.pandas.ChemSeries method)
unitcell (oddt.toolkits.ob.Molecule attribute)
unstack() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
update() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
(oddt.toolkits.ob.MoleculeData method)
(oddt.toolkits.rdk.MoleculeData method)
usr() (in module oddt.shape)
usr_cat() (in module oddt.shape)
usr_similarity() (in module oddt.shape)

V

valence (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
valid() (oddt.pandas.ChemSeries method)
value_counts() (oddt.pandas.ChemSeries method)
values (oddt.pandas.ChemDataFrame attribute)
(oddt.pandas.ChemPanel attribute)
(oddt.pandas.ChemSeries attribute)
values() (oddt.toolkits.ob.MoleculeData method)
(oddt.toolkits.rdk.MoleculeData method)
var() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
vector (oddt.toolkits.ob.Atom attribute)
view() (oddt.pandas.ChemSeries method)
vina_docking (class in oddt.docking.internal)
vina_ligand (class in oddt.docking.internal)
virtualscreening (class in oddt.virtualscreening)

W

weighted_inter() (oddt.docking.internal.vina_docking method)
weighted_intra() (oddt.docking.internal.vina_docking method)
weighted_total() (oddt.docking.internal.vina_docking method)
where() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)
write() (oddt.toolkits.ob.Molecule method)
(oddt.toolkits.ob.Outputfile method)
(oddt.toolkits.rdk.Molecule method)
(oddt.toolkits.rdk.Outputfile method)
(oddt.virtualscreening.virtualscreening method)
write_csv() (oddt.virtualscreening.virtualscreening method)

X

xs() (oddt.pandas.ChemDataFrame method)
(oddt.pandas.ChemPanel method)
(oddt.pandas.ChemSeries method)